Caracterización de péptidos de alta unión de la proteina ama-1 mediante la probabilidad y la entropía

Autores: Rodríguez Velásquez Javier Oswaldo, Prieto Bohórquez Signed, Bernal Pedro, Correa Herrera Catalina, Álvarez Luisa, Soracipa Muñoz Yolanda, López Fredy, Vitery Erazo Sarith

Resumen

La probabilidad y la entropía han sido empleadas para caracterizar física y matemáticamente péptidos de alta unión de proteínas de malaria al eritrocito. Estudios sugieren que la proteína AMA-1 del Plasmodium Falciparum se une al eritrocito posiblemente jugando un papel en la infección. Se efectuó una cuantificación de la frecuencia de aparición de los 20 aminoácidos esenciales en cada una de las posiciones de los péptidos de 20 residuos que constituyen la proteína AMA-1, a partir de la construcción de un espacio de probabilidad no equiprobable, y se calcularon los valores de probabilidad, sumatoria de probabilidad y entropía para cada una de las secuencias peptídicas. Se encontró que los valores de probabilidad, sumatoria de probabilidad y entropía para las secuencias que no se unen varían entre los valores asociados al macroestado de no unión, mientras que dichos valores para las secuencias específicas de unión comprobadas experimentalmente se encuentran fuera de dichos rangos, conformando rangos específicos diferenciados asociados al macroestado de unión. Se diferenciaron secuencias de unión y de no unión con la metodología empleada, acertando en el 100% de los casos estudiados, caracterizando así los péptidos de AMA-1 de una forma objetiva y reproducible, y evidenciando un orden físicomatemático subyacente al fenómeno de unión.

Palabras clave: AMA-1 probabilidad entropía unión eritrocito.

2011-08-12   |   855 visitas   |   Evalua este artículo 0 valoraciones

Vol. 33 Núm.2. Abril-Junio 2011 Pags. 83-91 Medicina Ac. Col. 2011; 33(2)